Les gels électrophorétiques servent à trier des molécules chimiques. Le but est d'analyser en détail les constituants de la matière biologique. Le plus souvent, deux caractéristiques complémentaires sont utilisées, par exemple la charge, et l'encombrement spatial des molécules. Le résultat du tri est une plaque rectangulaire recouvertes de molécules disposées selon un degré croissant de l'une des deux caractéristiques pour un des axes de la plaque. L'autre caractéristique correspond à l'autre axe.

Cette plaque est ensuite exposée à un colorant qui montre une affinité sélective pour certaines molécules. Comme les molécules ont été triées, l'affinité sélective conduit à une série de taches sur la plaque qui est ensuite photographiée, ce qui donne une carte électrophorétique. On considère que l'information utile de cette carte peut être résumée par la position des taches, leur forme, leur intensité et leur taille. Le but du projet est de construire un programme d'analyse automatique de la carte électrophorétique pour en extraire les caractéristiques citées.
Collaboration: Swiss Institute of Bioinformatics
Geneva University Hospital and University of Geneva