Dans un grand nombre d'étude biologique, on a recours à une étude histologique pour comprendre la structure, le renouvellement et les échanges cellulaires de tissus. Afin de distinguer les différents tissus, on utilise une coloration et on acquiert des images sous microscope. Les images présentent un certain nombre de défauts, comme un effet de flou et un fond non uniforme. Il est alors important de disposer d'outils d'analyse d'images permettant de sélectionner des tissus cellulaires ayant une couleur spécifique pour mesurer leurs caractéristiques spatiales.
Le but du projet est de proposer et de segmenter une image en région de couleur homogène basée sur un algorithme de classification type "k-means". Des extensions possibles du programme sont: correction couleur des non-uniformité de l'éclairage et/ou interaction avec l'utilisateur pour le choix final des régions.
Ce programme sera développé en Java et fera l'objet d'un plugin ImageJ.