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| Création de mosaïque d'images en imagerie biomédicale |
David Lambiel
Section Microtechnique, EPFL |
Semester project
June 2004 |
Abstract |
Lors de prises de vues au microscope à très haute résolution, les images obtenues ne donnent pas une vue globale du sujet, mais sont au contraire très locales. L'idée est donc de prendre une série de prises de vue avec un certain recouvrement, puis de recomposer l'image complète, appelée image mosaïque.
Le but de ce projet est d'offrir un outil permettant le positionnement approximatif des images les unes par rapport aux autres, puis d'utiliser des méthodes crées au BIG afin de trouver les positionnements relatifs les plus précis possibles. Au final, on utilisera les données obtenues afin de créer l'image complète.
Pour ce faire, une interface java a été développée sous forme de plug-in pour ImageJ. Celui-ci va créer des vignettes de chaque image, spécifiée par l'utilisateur, et les afficher avec des effets de transparence afin de permettre à l'utilisateur de positionner au mieux les images. Par l'intermédiaire du plug-in TurboReg, il va obtenir les positions précises des images, y compris les rotations de faible amplitude. Ensuite, une image complète est recrée.
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