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| Modélisation des taches d'un gel électrophorétique
par mixture et/ou par dictionnaire de fonctions de base |
Christophe Gusthiot
Section Microtechnique, EPFL |
Semester project
Juin 2004 |
Résumé |
L'ISB (Institut Suisse de Bioinformatique) tente de comprendre le rôle
de chaque gène du génome par le biais des protéines
exprimés par ceux-ci, les protéomes. Par 2 moyen de
migration, ces protéomes sont répandus en 2D sur une plaque
recouverte d'un gel électrophorétique. Un réactif
est ajouté afin que les protéomes que l'on désire
étudier en particulier apparaissent en noir.
Le but de ce projet est de traiter ces images contenant des taches
représentant les dits protéomes, et de ressortir dans un
fichier, en tant que données numériques, la position, la
forme et l'intensité de ces taches, afin de pouvoir comparer plus
simplement, et surtout informatiquement, deux images obtenues lors de deux
situations différentes. Le fichier de sortie contient les
paramètres de la modélisation des taches obtenue à
l'aide d'un B-spline de degré 3: g(x,y)=lambda*B3(a11*(x-x0))*B3(a22*(y-y0))
ou (x0,y0) est le centre du modèle, (a11,a22) les paramètres
de dilatation du B-spline et lambda le facteur d'intensité. |
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=>
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Original
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Modélisation
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