Obtenir la PSF d'un système de microscopie de fluorescence
E. Soubies, D. Sage
Proceedings of the Ninth Edition of the CNRS Thematic School, Functional Microscopy for Biology (MiFoBio'21), Presqu'île de Giens, French Republic, November 5-12, 2021, pp. 109
Em microscopie de fluorescence à haute résolution 3D, les techniques numériques jouent un rôle crucial, que ce soit pour la déconvolution, la microscopie à illumination structurée (SIM) ou la microscopie par localisation de molécules (SMLM). Tous ces problèmes de reconstruction/restauration computationnelle nécessitent une très bonne connaissance de la réponse du système qui est principalement encodée dans la fonction d'étalement du point (i.e. point-spread function PSF). En effet, il est essentiel d'être en mesure d'obtenir une bonne estimation de la PSF afin d'assurer une reconstruction fidèle à l'échantillon observé. En pratique, il y a deux écoles: ceux qui font confiance à une PSF théorique calculée à partir des paramètres optiques, et ceux qui préfèrent une PSF expérimentale estimée à partir d'acquisitions de microbilles fluorescentes.
Dans ce contexte, cet atelier a pour objectif de présenter aux participants l'importance de la PSF pour les algorithmes de reconstruction ainsi que les différentes façons d'obtenir des PSF théoriques et expérimentales (i.e., à partir de microbilles fluorescentes). Les participants seront formés à l'utilisation d'outils open-source (sous-forme de plugins ImageJ) leur permettant de réaliser cette tâche.
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