Poursuite de neurones dans une séquence d'images
Autumn 2003
Master Semester Project
Project: 00055

La migration cellulaire des neurones joue un rôle important dans le développement du système nerveux. Afin de mieux comprendre les phénomènes en jeu, des biologistes étudient in-vitro les trajectoires de jeunes neurones avant qu'ils aient atteint leur destination finale. L'observation est effectuée à partir de vidéo de microscopie. Le problème est de caractériser les trajectoires de plusieurs dizaines de neurones dans une séquence d'images. Des outils automatiques de traitement d'images s'avèrent indispensable pour analyser une aussi grande quantité d?information.
Le but du projet est d'étudier les algorithmes de poursuite d?objets dans des séquences d'image, de proposer un algorithme adapté à la poursuite de neurones avec en particulier l'initialisation automatique et d?implémenter cet algorithme de poursuite multi-neurones. Le programme sera écrit en Java et fera l'objet d'un plugin de ImageJ.
Les vidéo sont fournies par un neurophysicien Dr. Paolo Ariano, DBAU et INFM, Université de Turin, Italie.
Connaissances souhaitables Traitement d?images et programmation
- Supervisors
- Daniel Sage, daniel.sage@epfl.ch, 021 693 51 89, BM 4.135
- Michael Unser, michael.unser@epfl.ch, 021 693 51 75, BM 4.136