En analyse d'images biologiques, un problème récurrent est de détecter des objets comme des cellules ou des particules dans des images fortement bruitées. Une méthode particulièrement robuste consiste à modéliser l'objet recherché par une forme géométrique simple comme un disque, un anneau ou une ellipse qui permet de décrire l'objet avec peu de paramètres. La détection de l'objet peut alors être effectué par une procédure itérative d'optimisation d'un jeu de paramètres. L'étudiant devra étudier et implémenter cet algorithme en Java pour ImageJ. L'algorithme sera ensuite testé sur des séquences d'images montrant un noyau d'une cellule vivante. Ces images de microscopie en fluorescence proviennent du Département de Biologie Moléculaire de l'Université de Genève.