La cryo-microscopie électronique (CEM) permet de visualiser des molécules d'ADN qui se présentent sous la forme de filaments dans des images fortement bruitées. Les techniques usuelles de détection basées sur un filtrage linéaire sont très coûteuses en temps de calcul lorsque l'on veut détecter des filaments orientés dans des directions inconnues. Le but du projet est de développer un algorithme de corrélation avec des filtres orientables qui permettent de détecter des structures allongées dans les images de façon beaucoup plus efficace que les filtres classiques. Ces filtres orientables peuvent avoir un grand intérêt pour la détection de tous les types de structures allongées dans les images. Le prototypage de l'algorithme sera effectué en Matlab puis l'étudiant implémentera une version rapide en Java comme un plugin de ImageJ.