Relevé de l'arbre dendritique dans des images confocales 3D
Autumn 2004
Master Semester Project
Project: 00066
L'activité synaptique générée par les réseaux neuronaux en développement est un processus complexe dont va dépendre l'intégrité fonctionnelle au stade adulte. Le type d'activité ainsi que les mécanismes cellulaires mis en oeuvre pendant cette phase de développement sont encore peu connus. Une équipe de l'ISREC cherche à quantifier l'activité synaptique capable d'influencer le développement morphologique des neurones. Pour mener à bien ces recherches l'ISREC a développé un modèle expérimental in vitro et effectue des études morphologiques à partir d'acquisition d'images confocales sur lesquelles est relevé l'abre dendritique.
Le but du projet est de développer un programme d'analyse d'image qui permettra de suivre les dendrites et les différents branchements en 3D et qui effectuera les mesures caractérisant le développement de l'arbre dendritique. Le programme, codé en Java, fera l'objet d'un plugin ImageJ avec une interface utilisateur conçu pour des biologistes.
Collaboration: Nathalie Garin, Institut Suisse de Recherche Expérimentale sur le Cancer (ISREC)
Le but du projet est de développer un programme d'analyse d'image qui permettra de suivre les dendrites et les différents branchements en 3D et qui effectuera les mesures caractérisant le développement de l'arbre dendritique. Le programme, codé en Java, fera l'objet d'un plugin ImageJ avec une interface utilisateur conçu pour des biologistes.
Collaboration: Nathalie Garin, Institut Suisse de Recherche Expérimentale sur le Cancer (ISREC)
- Supervisors
- Michael Sühling
- Daniel Sage, daniel.sage@epfl.ch, 021 693 51 89, BM 4.135