L'imagerie spectroscopique, ou "chemical shift imaging - CSI", permet d'obtenir une cartographie métabolique non-invasive. Par exemple, il est possible d'obtenir simultanément un grand nombre de spectres réparti dans le plan d'une coupe du cerveau. Le principal avantage du CSI par rapport aux acquisitions classiques en mono-voxels réside dans le fait que, pour le même temps d'acquisition, il est possible d'obtenir plusieurs spectres adjacents répartis dans le plan, avec le même signal-sur-bruit qu'un spectre obtenu individuellement. Cependant, l'approche CSI a un inconvénient majeur, lié au nombre réduit de points d'échantillonnage. Ceci a comme conséquence de contaminer les voxels voisins par une fonction de dispersion spatiale (point spread function -PSF), liée au fait que chaque point de l'espace est convolué avec une fonction sinc. Ceci est particulièrement préjudiciable en imagerie spectroscopique à cause de la très forte concentration de lipide (environ 4'000 fois plus intense que les métabolites) en périphérie du cerveau.
Evaluation de différentes méthodes de correction des artéfacts liés au PSF et à la présence de lipides périphériques (filtrage spatiale, interpolation, etc...). En particulier, nous proposons d'appliqués une méthode de solution inverse (déconvolution) à la cartographie métabolique. Pour ce faire, le candidat disposera de données obtenues sur fantôme (sphère contenant les principaux métabolites - de concentrations connues - entourée de lipides) et échantillon point (grandeur d'un pixel) de même que des données réelles obtenues chez des sujets sains.
Le projet se déroulera à l'hôpital universitaire de Genève (HUG). Les outils d'acquisition, de transfert et de sauvegarde sont à disposition. Le projet pourra s'effectuer sur station Unix, Linux, PC ou Mac, et pourra utiliser des logiciels de développement tels que IDL ou Matlab.
Collaboration: Prof. François Lazeyras, HUG