L'utilisation du marquage coloré en histologie restera encore longtemps très utilisée pour sa simplicité d’utilisation, sa rapidité de résultats et surtout pour la longue durée de vie des échantillons coloré (plusieurs années) en comparaison à la fluorescence (quelques semaines). Dans le cadre de ce projet, on se propose d'étudier le nombre, la taille et la forme des cellules adipeuses afin de connaître l’efficacité des traitements anti-adipeux et l’effet des variabilités génétiques sur la gestion des graisses. Au niveau du traitement d'images, la difficulté réside dans le fait que seulement une partie de la membrane est visible dans les images. Nous proposons donc d'utiliser des algorithmes de contours actifs "snake" qui iront s'accrocher à la membranes des cellules sous contraintes de forme définie par un modèle paramétrique simple. Le programme sera développer en Java et fera l'objet d'un plugin Java pour ImageJ.

Collaboration: Juan Carlos Sarria, BioImaging and Optics Platform, School of Life Sciences, EPFL